More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0218 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  100 
 
 
396 aa  801    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  73.59 
 
 
417 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  57.87 
 
 
391 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  42.03 
 
 
376 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  38.2 
 
 
387 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  38.99 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  31.54 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  29.11 
 
 
347 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  28 
 
 
317 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  28.12 
 
 
417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  29.32 
 
 
522 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  35 
 
 
523 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  27.06 
 
 
330 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  33.21 
 
 
576 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  33.21 
 
 
576 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
589 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  26.7 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  27.23 
 
 
329 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.88 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  22.03 
 
 
515 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  26.33 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.61 
 
 
481 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.54 
 
 
421 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  26.51 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  26.06 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.72 
 
 
378 aa  89.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.8 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.44 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.04 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.62 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.46 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.73 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.73 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.82 
 
 
479 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.24 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  27.68 
 
 
475 aa  82.8  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.49 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.46 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.39 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.26 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  25.94 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.94 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.71 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  24.1 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.8 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.41 
 
 
480 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.54 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  26.5 
 
 
473 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  25.53 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.12 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.58 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.18 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.7 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.7 
 
 
441 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.67 
 
 
472 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.89 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  24.48 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 
508 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.24 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.07 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  24.38 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  26.28 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.27 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.06 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  23.26 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  24.19 
 
 
491 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.26 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.26 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.26 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 
549 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 
549 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.19 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.5 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  21.6 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.71 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  23.99 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.59 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  22.85 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.15 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.3 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.76 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  21.6 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.56 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.33 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  23.96 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.74 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.36 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.36 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.6 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.23 
 
 
455 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.97 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.58 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.16 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.74 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.33 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.33 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  32.5 
 
 
550 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.76 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.81 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>