84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0046 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  55.38 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  49.24 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  53.08 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  50 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  42.06 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  35.11 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  36.64 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  40.8 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  34.68 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  31.58 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  36.88 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35.07 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  34.88 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  36.13 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  33.63 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  35.43 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  35.07 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  36.22 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  34.62 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  34.62 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  36.3 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  42.47 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  35.38 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  31.34 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  45.59 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  30.88 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  29.85 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  35.94 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  31.62 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  53.66 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  34.38 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  29.69 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  42 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  28.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  27.13 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  40.91 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  40.82 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  25.78 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  27.69 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  31.82 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  30.3 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  38.89 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  36.96 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  36.96 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  38.24 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  32 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  42.22 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  27.71 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  30.43 
 
 		 124 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  33.87 
 
 		 134 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  46.51 
 
 		 74 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  32.39 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  46.51 
 
 		 74 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  30.51 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  37.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  31.08 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  45.83 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  42.42 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  26.43 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>