More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1089 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  86.8 
 
 		 197 aa  348  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  52.82 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  49.23 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  51.83 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  48.91 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  45.6 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  42.37 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  41.3 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  43.1 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  35.56 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  39.55 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  32.58 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  37.22 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  26.73 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 340 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 		 343 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 		 343 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  28.64 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 567 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 		 449 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  28.5 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.72 
 
 		 862 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  34.81 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 521 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 		 903 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.54 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  28.77 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 456 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.07 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.75 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.67 
 
 		 600 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  29.1 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  23.47 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25.89 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  29.81 
 
 		 493 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  26.9 
 
 		 286 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.04 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  23.98 
 
 		 401 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 825 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.43 
 
 		 311 aa  64.7  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 825 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 825 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 825 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 825 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.06 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 825 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  24.22 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  26.9 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 862 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  33.58 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  28.18 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  30.32 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  29.19 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  29.28 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1033 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.67 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  26.88 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  27.44 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.45 
 
 		 517 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  31.16 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  24.5 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26.92 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  31.47 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  30.25 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  24.14 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  27.23 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  23.3 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  28.28 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.81 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.29 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>