More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5035 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  44.35 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  36.89 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  29.93 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  58.33 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  36.21 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  36.59 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  31.25 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  32.73 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  35.56 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  31.68 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 141 aa  48.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  32.94 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 151 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2219  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  35.29 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 157 aa  47.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  26.05 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.72 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  40.96 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>