More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3692 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 218 aa  453  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  72.48 
 
 		 218 aa  339  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  64.32 
 
 		 223 aa  287  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  55.96 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  56.42 
 
 		 218 aa  264  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  57.67 
 
 		 216 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  55.96 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  56.74 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  56.81 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  47.42 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  47.89 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  33.64 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.05 
 
 		 261 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  29.95 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  28.12 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.86 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  26.56 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32 
 
 		 870 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  29.61 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  29.61 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 521 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.04 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.3 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.55 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  27 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  24.44 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  23.7 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  32.21 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  25.69 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.28 
 
 		 607 aa  65.1  0.0000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  24.83 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  26.15 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 517 aa  65.1  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  27.1 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  30.38 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.88 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  24.86 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  28.34 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  27.53 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  30.49 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  27.43 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  31.79 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  24.88 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  29.15 
 
 		 844 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  30.49 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  26.79 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  27.47 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 872 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  25.71 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.44 
 
 		 401 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  26.44 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.44 
 
 		 401 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  25.79 
 
 		 600 aa  61.6  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.13 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  28.11 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  27.1 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  26.34 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  28.92 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  27.1 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  24.58 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  24.58 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  29.86 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  24.27 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  29.65 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  27.15 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1033 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  26.63 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.89 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.17 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  26.15 
 
 		 872 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>