More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3358 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  74.47 
 
 		 191 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  73.16 
 
 		 193 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 202 aa  265  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 194 aa  264  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 202 aa  261  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 202 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 190 aa  260  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 200 aa  259  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  65.95 
 
 		 201 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  65.95 
 
 		 201 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  65.95 
 
 		 189 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  62.7 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 194 aa  232  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  55.96 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 195 aa  171  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
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NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 203 aa  97.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
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NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
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NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
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NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  27.27 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.74 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
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NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
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NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
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NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
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