More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1021 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 390 aa  771    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.59 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.62 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.37 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.05 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  37.27 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  39.21 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.37 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  35.58 
 
 		 357 aa  216  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.99 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  34.49 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  35.1 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  34.35 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  31.13 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  32.59 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  32.37 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  32.05 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  32.57 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  33.22 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.62 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  32.67 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  32.67 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  32.67 
 
 		 360 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  32.95 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.54 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  31.08 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  31.61 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  33 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.07 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  31.49 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  32.66 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  33 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  31.77 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  34.24 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.27 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  29.56 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  31.78 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  29.56 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  28.76 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  30.59 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.5 
 
 		 371 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  31.54 
 
 		 368 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  27.44 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.01 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 		 373 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.77 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  29.27 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  28.95 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  31.77 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01700  RND family efflux system membrane fusion protein  28.36 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  27.09 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  28.27 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.88 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  31.65 
 
 		 353 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  29.85 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  30.92 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  27.72 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>