More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1914 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  44.13 
 
 		 896 aa  710    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  43.56 
 
 		 893 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  44.19 
 
 		 895 aa  714    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  97.19 
 
 		 890 aa  1784    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  97.19 
 
 		 890 aa  1783    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 890 aa  1824    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  41.93 
 
 		 899 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  37.06 
 
 		 866 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 891 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  31.5 
 
 		 922 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 925 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 861 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 861 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 861 aa  350  9e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 883 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 883 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 883 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31.12 
 
 		 884 aa  347  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  30.59 
 
 		 827 aa  337  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 855 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 924 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 924 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 924 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 852 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 872 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 861 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 861 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 861 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 857 aa  324  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 894 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 842 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 875 aa  319  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 847 aa  320  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 886 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 886 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 892 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 869 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 849 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 882 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 882 aa  303  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 874 aa  302  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 867 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 867 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 869 aa  300  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 867 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 867 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 871 aa  297  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 908 aa  292  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 853 aa  289  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 853 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 841 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 909 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 853 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 853 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 855 aa  288  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 896 aa  288  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.84 
 
 		 853 aa  286  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 937 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 927 aa  284  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 866 aa  283  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 935 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 836 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 876 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 843 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  30.08 
 
 		 839 aa  281  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 855 aa  281  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.19 
 
 		 936 aa  279  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 909 aa  279  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 928 aa  277  7e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 935 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 935 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 935 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 930 aa  271  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 942 aa  270  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 901 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 930 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 930 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 879 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.6 
 
 		 880 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 973 aa  269  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 933 aa  269  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 838 aa  269  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 910 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 956 aa  267  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 974 aa  263  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 944 aa  263  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.57 
 
 		 966 aa  261  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 904 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 817 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 800 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 846 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 873 aa  257  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 975 aa  257  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 869 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.45 
 
 		 877 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 944 aa  254  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 944 aa  251  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 873 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 892 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 985 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>