89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4728 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  100 
 
 
245 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  65.04 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  37.21 
 
 
239 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  37.21 
 
 
239 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  37.21 
 
 
239 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  37.21 
 
 
239 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  38.29 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  34.55 
 
 
225 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  31.05 
 
 
223 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  29.09 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  31.91 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  33.57 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  28.99 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  28.67 
 
 
279 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.36 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  26.92 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30.87 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30.87 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  28.69 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  35.92 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  30.83 
 
 
286 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25.1 
 
 
359 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  28.63 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  27.92 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  32.33 
 
 
285 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  26.52 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  36.46 
 
 
409 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  32.33 
 
 
285 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  29.39 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  30.6 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  27.27 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  27.63 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  31.68 
 
 
268 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  29.46 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.14 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  29.52 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  21.9 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  32.56 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  35.51 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  32.58 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2611  hypothetical protein  28.74 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000236104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  28.28 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  26.07 
 
 
224 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  38.1 
 
 
236 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  30.08 
 
 
212 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  27.05 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  26.03 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  30.06 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  27.64 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  28.28 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  32.95 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  32.95 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  24.07 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.81 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  29.8 
 
 
316 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  28.93 
 
 
288 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4183  hypothetical protein  24.71 
 
 
223 aa  48.5  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000462682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  22.98 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  28 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  33.62 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  30.92 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  27.91 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  30.19 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  30.77 
 
 
275 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  31.52 
 
 
284 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  27.13 
 
 
201 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2179  hypothetical protein  27.62 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  30.53 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  24.67 
 
 
278 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  26.72 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  29.41 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  28 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07081  hypothetical protein  29.29 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148035  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  28.57 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.65 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  28.44 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2342  hypothetical protein  32.22 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0583  hypothetical exported membrane spanning protein  27.78 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0248013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  27.45 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  24.76 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 
364 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  27.66 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  29.31 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  24.76 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  28.3 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  30.14 
 
 
190 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1574  hypothetical protein  27.27 
 
 
259 aa  42  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646728  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  23.89 
 
 
278 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>