48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1171 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  58.82 
 
 
202 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  38.89 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  37.43 
 
 
195 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  38.14 
 
 
203 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  35.21 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  34 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  38.25 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  36 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  39.25 
 
 
202 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  29.66 
 
 
229 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  28.88 
 
 
234 aa  94.7  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  39.72 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  32.14 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  33.01 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  32.83 
 
 
249 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  31.84 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  32 
 
 
227 aa  85.1  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  33.82 
 
 
196 aa  84.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  29.41 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  31.25 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  28.51 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  28.27 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  31.1 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  31.97 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  27.32 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  28.84 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.41 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  32.67 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  28.76 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  27.45 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  30.2 
 
 
359 aa  65.1  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0907  surface antigen msp4  30.15 
 
 
299 aa  52.4  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  31.82 
 
 
293 aa  50.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  28.92 
 
 
373 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  26.56 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  26.04 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  25.96 
 
 
357 aa  48.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  29.71 
 
 
340 aa  48.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  26.16 
 
 
401 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.13 
 
 
245 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  28.35 
 
 
263 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  28.87 
 
 
229 aa  44.7  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  27.91 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  28.11 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  26.58 
 
 
373 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  31.54 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  27.61 
 
 
236 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>