64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0921 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  100 
 
 
284 aa  590  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  99.3 
 
 
284 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  69.34 
 
 
285 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  35.37 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  36.21 
 
 
272 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  39.72 
 
 
274 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  35.93 
 
 
278 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  38.93 
 
 
274 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  36.11 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  38.17 
 
 
282 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  32.45 
 
 
265 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  38.43 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  33.21 
 
 
229 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  27.15 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  30.52 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  30.98 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  31.82 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  31.3 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  29.74 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  30.51 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  31.1 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  25.95 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  30.3 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  27.38 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  28.84 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  30.69 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25.88 
 
 
359 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  25.66 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  25.28 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  26.67 
 
 
222 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  35.11 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  27.94 
 
 
288 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  27.56 
 
 
409 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  27.13 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  27.13 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  25.71 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  25.71 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  37.5 
 
 
219 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  28.48 
 
 
238 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  28.21 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  24.9 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.06 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  28.75 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  37.21 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  38.37 
 
 
213 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  25.14 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  25.14 
 
 
239 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2179  hypothetical protein  25.48 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  25.29 
 
 
219 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  29.28 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  40 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  34.07 
 
 
206 aa  46.2  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  27.92 
 
 
181 aa  45.8  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  27.92 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  34.44 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  27.52 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  35.05 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  32.96 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  27.46 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13171  hypothetical protein  30.59 
 
 
104 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  35 
 
 
268 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0601337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>