66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2567 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  100 
 
 		 236 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  29.95 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  32.64 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  29.2 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  29.2 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  29.77 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  28.12 
 
 		 278 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  32.21 
 
 		 282 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  29.07 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  27.93 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  28.88 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  30.62 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  30.45 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  27.19 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  26.73 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  26.73 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  29.68 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  29.68 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  27.96 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  27.59 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  27.59 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  30.32 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  26.55 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  28.41 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  28.12 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  31.64 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  36.72 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  31.25 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  24.77 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  25 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  24.89 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  25.66 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  27.19 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  24.47 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  34.13 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  28.99 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  31.69 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  31.69 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  31.69 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  31.69 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  31.43 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  25.24 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  27.27 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  38.1 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  27.62 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  25 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  28.81 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  24.65 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  30.41 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  25.66 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  27.5 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  30 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  27.38 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  27.86 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  27.38 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  32.26 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  29.92 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  27.14 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32.56 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  30.95 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  36.59 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  25.84 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13171  hypothetical protein  35.48 
 
 		 104 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  35.96 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  35.96 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  28.8 
 
 		 202 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>