56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1932 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  55.02 
 
 
227 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  36.29 
 
 
229 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  38.84 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  36.48 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  35.94 
 
 
243 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  36.24 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  36.41 
 
 
212 aa  106  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  38.42 
 
 
194 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  36.62 
 
 
237 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  35.78 
 
 
202 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  39.02 
 
 
197 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  32.3 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  32.44 
 
 
201 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  36.82 
 
 
190 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  32 
 
 
195 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32.17 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  33.5 
 
 
195 aa  89.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  30.09 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  34.63 
 
 
190 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.04 
 
 
206 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  32.84 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.09 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  30.09 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  28.19 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  32.37 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  28.4 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.37 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  29.78 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  32.6 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  30 
 
 
186 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  31.43 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  28.17 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  29.18 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  31.74 
 
 
364 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  30.43 
 
 
181 aa  48.5  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25.42 
 
 
359 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  27.68 
 
 
357 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  30.28 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  30.56 
 
 
297 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  27.38 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  25.24 
 
 
373 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1125  major outer membrane protein OMP-1T  26.28 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  27.11 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  26.94 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  24.85 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  25.58 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  27.47 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  25.58 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  30.53 
 
 
288 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  26.94 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  25.78 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  25.78 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  30.33 
 
 
287 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>