49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2487 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  43.92 
 
 
195 aa  157  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  43.09 
 
 
183 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  44.32 
 
 
190 aa  148  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  40.32 
 
 
215 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  44.62 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  36.82 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  35.03 
 
 
195 aa  105  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  31.86 
 
 
203 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  32.5 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  37.16 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  28.64 
 
 
206 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  30.96 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  29 
 
 
229 aa  84.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  31.63 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  33.16 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  28.76 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  26.79 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  26.51 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.64 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.01 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  26.75 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  24.79 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  28.37 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  28.83 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  30.12 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  30.85 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  29.57 
 
 
227 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  36.43 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  36.43 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  27.63 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  31.75 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  30.25 
 
 
274 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  27.98 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 
359 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  30.83 
 
 
239 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  30.83 
 
 
239 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  27.39 
 
 
249 aa  48.9  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  30.83 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  30.83 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  31.08 
 
 
225 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  31.07 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  34.02 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  36.05 
 
 
229 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  30 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  24.54 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  23.93 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  29.13 
 
 
287 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.34 
 
 
245 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>