62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4218 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  86.55 
 
 		 236 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  86.55 
 
 		 236 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  43.52 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  31.91 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  27.71 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  30.77 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  28.12 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  30.06 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  30.77 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  26.83 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  26.83 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  26.83 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  26.83 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  28.64 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  28.1 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  29.65 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.61 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  28.41 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  27.64 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  28.11 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  29.07 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  27.37 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  26.82 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  26.03 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  29.72 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  27.46 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  27.75 
 
 		 288 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  30.26 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  30.06 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  27.17 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  28.09 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.12 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  24.86 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  32.8 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  31.5 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  24.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  26.97 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  31.51 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  34.21 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  26.47 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  31.94 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  29.89 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  33.33 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  28.57 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  26.07 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  37.97 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  26.7 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  24.57 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  27.04 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  28.27 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  28.17 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  31.3 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  42.22 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  24.9 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  30.9 
 
 		 583 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  42.42 
 
 		 378 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  29.27 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  27.43 
 
 		 229 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  26.17 
 
 		 285 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>