48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1552 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  42.51 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  41.43 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  37.9 
 
 		 243 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  38.81 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  37.74 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  35.85 
 
 		 237 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  37.93 
 
 		 227 aa  104  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  35.55 
 
 		 231 aa  104  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  32.43 
 
 		 249 aa  98.2  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  32.82 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  32.28 
 
 		 190 aa  84.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  33.33 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  31.09 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  29.63 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32.72 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  31.22 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  28.11 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  34.13 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  31.12 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.53 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  30.85 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  31.82 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  27.45 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  30.85 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.63 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.41 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.55 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  28.36 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  26.29 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  28.96 
 
 		 373 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 		 361 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  30.3 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  30.3 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  27.35 
 
 		 263 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30.73 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30.73 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  28.27 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  31.03 
 
 		 340 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  25.87 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  26.14 
 
 		 380 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  25.87 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  28.36 
 
 		 357 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  26.94 
 
 		 223 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  41.2  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  29.82 
 
 		 373 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>