49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1755 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  43.68 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  43.09 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  42.47 
 
 		 195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  45.45 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  43.48 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  36 
 
 		 195 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  35.82 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  33.52 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  35.44 
 
 		 206 aa  99  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  33.78 
 
 		 222 aa  97.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  34.8 
 
 		 203 aa  94.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  37.06 
 
 		 196 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  29 
 
 		 229 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  31.84 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  31.78 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  29.65 
 
 		 227 aa  77.4  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  28.34 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  30.34 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  32.83 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  31.53 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  29.63 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  27.08 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  27.31 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  30.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  30.59 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  28.5 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  27.27 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  28.64 
 
 		 359 aa  57.8  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  25.12 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  26.67 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  26.79 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  27.93 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  26.29 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  31.13 
 
 		 263 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  28.81 
 
 		 236 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 409 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  26.17 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  24.68 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  28.44 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  24.68 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  27.21 
 
 		 283 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  30.08 
 
 		 237 aa  41.6  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  25.29 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  25.29 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  25.29 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  25.29 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  28.16 
 
 		 245 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  25.29 
 
 		 219 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>