51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0226 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  44.28 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  43.6 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  42.75 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  40.34 
 
 		 231 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  37.6 
 
 		 237 aa  138  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  39.6 
 
 		 194 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  38.3 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  31.45 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  32.43 
 
 		 197 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32.27 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  31.94 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  34.4 
 
 		 202 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  32.83 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  30.42 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  28.06 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  30.56 
 
 		 195 aa  85.5  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  30.97 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.4 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  29.8 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  31.49 
 
 		 195 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  31.53 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  30.9 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  28.91 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  29.22 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  27.38 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  33.33 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  28.44 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  30.33 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.95 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  27.64 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  24.71 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  26.96 
 
 		 373 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30.27 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30.27 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  29.84 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  28.26 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  26.7 
 
 		 357 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.74 
 
 		 359 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  27.31 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  27.78 
 
 		 181 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  24.72 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  28.37 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  25.53 
 
 		 364 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  28.28 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  29.7 
 
 		 401 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  28.28 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  26.43 
 
 		 287 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  24.88 
 
 		 239 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>