51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1689 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1689  outer surface protein  100 
 
 
274 aa  554  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  99.27 
 
 
274 aa  547  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  73.82 
 
 
284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  44.36 
 
 
278 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  43.22 
 
 
275 aa  205  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  47.83 
 
 
282 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  44 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  40.46 
 
 
272 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  40.77 
 
 
265 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  39.72 
 
 
284 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  39.01 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  36.54 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  34.65 
 
 
229 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  34.07 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  32.59 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  32.59 
 
 
287 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  33.6 
 
 
227 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  29.74 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  31.2 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  29.96 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  28.74 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  30.74 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  31.2 
 
 
284 aa  85.5  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  32.08 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  29.74 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  31.12 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  33.75 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  33.33 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  31.05 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  30.77 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  34.78 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  27.78 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.4 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  32.49 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  28.76 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 
359 aa  55.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  29.55 
 
 
263 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  36.36 
 
 
219 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  29.87 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  30.17 
 
 
209 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  30 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  31.09 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  32.54 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.21 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  25.79 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  28.21 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  25.79 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  28.9 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  28.28 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  30.4 
 
 
190 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>