53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1225 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  100 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  69.93 
 
 
274 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  69.57 
 
 
274 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  46.95 
 
 
275 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  46.55 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  46.44 
 
 
278 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  44.44 
 
 
278 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  42.96 
 
 
272 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  40.98 
 
 
265 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  36.49 
 
 
284 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  36.27 
 
 
284 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  36.74 
 
 
285 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  34.77 
 
 
229 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  32.27 
 
 
287 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  32.27 
 
 
287 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  31.33 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  31.9 
 
 
288 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  30.12 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  30.47 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  32.39 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  32.09 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  32.9 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  30.65 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  31.03 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  28.33 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  32.91 
 
 
279 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  33.2 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  32.78 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  30.98 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  32.22 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  26.96 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  27.91 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  34.64 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  29.05 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 
222 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  30.13 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  31.62 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  26.92 
 
 
219 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  31.55 
 
 
206 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  29.23 
 
 
239 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  29.23 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  29.23 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  29.23 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  30.04 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  30.06 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  31.52 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  29.41 
 
 
203 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  33 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  28.37 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  29.29 
 
 
229 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.83 
 
 
209 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  25.11 
 
 
364 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  29.57 
 
 
213 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>