95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2636 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  53.1 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  54.71 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  54.67 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  52.51 
 
 		 213 aa  228  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  50.67 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  33.49 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  31.72 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  30.7 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  29.95 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  34.69 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  30.23 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  32.06 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  31.79 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  31.09 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  28.05 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  29.65 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  30.8 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  30.8 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.95 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  29.71 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  31.58 
 
 		 195 aa  72  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  27.31 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  34.13 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  37.39 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  29.41 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  31.03 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  29.21 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  29.21 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  29.55 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  31.4 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  31.4 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  30.12 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  29.17 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  26.95 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  29.06 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  26.92 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  38.06 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  27.23 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  32.54 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  30.85 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  33.33 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  29.21 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  28.48 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  26.67 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  25.23 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  27.93 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 373 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  28.63 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  25.81 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  33.61 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  32.23 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  30.23 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  31.61 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  25.78 
 
 		 373 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  26.32 
 
 		 284 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  26.44 
 
 		 316 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  29.1 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  27 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  26.15 
 
 		 257 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  26.29 
 
 		 285 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  29.58 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  26.29 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  29.58 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  29.58 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  26.67 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  29.27 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  29.27 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  29.44 
 
 		 361 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.47 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  24 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  26.02 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  28.46 
 
 		 340 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  28.66 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  31.5 
 
 		 265 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  25.88 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  24.78 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  24.62 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  23.08 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0739  hypothetical protein  28.08 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0934469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  26.09 
 
 		 409 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  23.56 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07081  hypothetical protein  26.02 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  27.83 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0916  surface antigen msp4  25.6 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0295969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  29.13 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2342  hypothetical protein  26.95 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  23.81 
 
 		 213 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>