70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2117 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  51.2 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  54.79 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  50.85 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  47.09 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  39.69 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  38.14 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  38.1 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  38.59 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  37.56 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  35.89 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  38.8 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  31.78 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  35.57 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  31.65 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  34.8 
 
 		 183 aa  94.7  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  33.49 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  94.4  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  32.49 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  34.21 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  31.9 
 
 		 227 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  35.53 
 
 		 227 aa  88.2  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  34.18 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 		 249 aa  85.1  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  31.31 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  29.88 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  30.54 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  29.63 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  30.59 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  32.72 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  29.03 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  32.86 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  28.48 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  31.5 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  30.07 
 
 		 373 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  36.44 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  25.47 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  36.78 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  32 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  33.33 
 
 		 265 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  32 
 
 		 278 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  32 
 
 		 284 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  32 
 
 		 284 aa  48.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  35.19 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  31.94 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  29.41 
 
 		 284 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  29.44 
 
 		 357 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  26.83 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  26.83 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  26.83 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  26.83 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  29.51 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2179  hypothetical protein  32.35 
 
 		 257 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  28.97 
 
 		 373 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  29.13 
 
 		 263 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  28.9 
 
 		 274 aa  44.7  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  28.9 
 
 		 274 aa  44.7  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  36.67 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  36.67 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  28.69 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  32.56 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  28.69 
 
 		 287 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12641  hypothetical protein  28.66 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.536745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  28.06 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  30.4 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.66 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  30.25 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  30.11 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>