48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3488 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  96.04 
 
 
278 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  60.89 
 
 
272 aa  341  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  60.44 
 
 
275 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  47.64 
 
 
282 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  44.73 
 
 
274 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  44.36 
 
 
274 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  45.31 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  35.93 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  35.59 
 
 
284 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  39.48 
 
 
265 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  35.98 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  34.63 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  31.45 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  30.26 
 
 
284 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  28.98 
 
 
266 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  30.39 
 
 
280 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  36.61 
 
 
287 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  31.14 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  36.22 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  36.61 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  31.68 
 
 
297 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  32.24 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  34.31 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  28.01 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  34.31 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  31.56 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  31.25 
 
 
227 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  30.6 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  28.57 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  31.06 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  33.77 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.06 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  27.21 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  27.71 
 
 
236 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  26.62 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  21.61 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32 
 
 
203 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  28.14 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  24.32 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  24.34 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  26.15 
 
 
409 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  22.86 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  26.88 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  27.42 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.56 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.48 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  28.02 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>