52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3602 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  60.89 
 
 		 278 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  60.89 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  57.4 
 
 		 275 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  46.55 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  40.84 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  40.46 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  43.04 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  36.21 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  35.86 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  37.71 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  33.79 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  31.43 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  34.78 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  31.72 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  30 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  30.52 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  30.09 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  30.74 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  32.19 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  32.19 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  31.37 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  28.89 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  33.6 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  31.73 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  33.2 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  33.04 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  28.78 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  28.07 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  30.77 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  26.95 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  30.18 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  29.28 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  29.39 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  26.33 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  25.31 
 
 		 409 aa  52.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  31.2 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  26.13 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  25.91 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  27.23 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  25.78 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  27.75 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 		 359 aa  45.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  27.21 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.78 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  30.4 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  28.96 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  31.2 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  24.9 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  31.5 
 
 		 206 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>