49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2118 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  51.71 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  53.17 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  40.8 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  47.16 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  44.85 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  38.12 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  41.57 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  41.05 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  38.81 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  37.55 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  37.64 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  34.98 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  32.84 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  37.19 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  33.02 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  35.32 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  32.05 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  31.78 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  32.35 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  34.22 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  29.65 
 
 		 227 aa  89  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  35.17 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  32.24 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  31.74 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  32.49 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  34.45 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  33.63 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  31.86 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  30.69 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  29.78 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  30.33 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  28.57 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  28.57 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  29.87 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25.34 
 
 		 359 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  27.57 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  27.03 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  29.71 
 
 		 373 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  26.32 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  25.73 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.71 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  33.62 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  25.73 
 
 		 287 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  28.1 
 
 		 373 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  33.09 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  25.42 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  28.57 
 
 		 293 aa  41.6  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>