80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1916 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  100 
 
 		 206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  51.2 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  52.63 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  52.66 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  42.78 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  41.26 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  43.08 
 
 		 190 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  42.7 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  35.89 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  35.21 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  36.6 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  35.44 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  32.64 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  33.62 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  33.61 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  30.84 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  33.49 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  30.88 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  34.16 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.72 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  30.34 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  32.46 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  33.51 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  27.88 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  29.61 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  26.67 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  28.04 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  33.03 
 
 		 249 aa  72  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  31.47 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  30.53 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  27.43 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  36.5 
 
 		 229 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  29.52 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  31.65 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  31.65 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  27.82 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  27.82 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  29.68 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 401 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.14 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  27.5 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  28.07 
 
 		 373 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  31.55 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  29.29 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  28.99 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  28.26 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  31.54 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  27.35 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 		 361 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  33.06 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  31.4 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  31.4 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  32.52 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  34.07 
 
 		 284 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  24.74 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  34.07 
 
 		 284 aa  46.2  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2861  hypothetical protein  29.1 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  37.08 
 
 		 285 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  31.09 
 
 		 274 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  31.09 
 
 		 274 aa  45.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  30.09 
 
 		 225 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  26.24 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  30 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  32.95 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  27.43 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  34.62 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  27.97 
 
 		 409 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2340  hypothetical protein  24.78 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  27.08 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  31.82 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  29.37 
 
 		 213 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  31.5 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3401  hypothetical protein  26.52 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>