33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0432 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  100 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  56.9 
 
 
229 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  45.26 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  44.21 
 
 
243 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  42.27 
 
 
234 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  40.34 
 
 
249 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  39.58 
 
 
222 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  39.11 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  35.55 
 
 
197 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  33.64 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  28.63 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  30.59 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  27.4 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  26.67 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  27.32 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.14 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  29.27 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  27.31 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  25.6 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  28.11 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  28.37 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  27.43 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  24.77 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  27.31 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  29.78 
 
 
202 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  27.23 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  25.45 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  28.37 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  25.12 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25.74 
 
 
359 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  27.98 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  40.35 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2186  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>