62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4837 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  583  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  98.61 
 
 		 287 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  92.01 
 
 		 288 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  56.38 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  41.3 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  41.99 
 
 		 330 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  36.69 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  37.58 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  37.05 
 
 		 274 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  37.37 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  41.03 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  40.17 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  37.12 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  37.63 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  36.49 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  32.56 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  36.03 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  35.78 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  40.79 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  35.84 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  34.82 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  32.37 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  31.32 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  31.87 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  37.36 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  32.06 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  33.21 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  30.12 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  32.71 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  29.96 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  28.83 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  28.83 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  30.19 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  34.15 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  32.5 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  32.5 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  32.5 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  32.5 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  26.38 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  35.79 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  27.57 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  29.21 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  28.19 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  28.19 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  32.95 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  27.17 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  35.87 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  31.4 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  24.91 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 		 359 aa  46.2  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  23.5 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  28.23 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  25.73 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  28.69 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  29.81 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  30 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  24.23 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  32.5 
 
 		 195 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  25.37 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  28.36 
 
 		 237 aa  42  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>