55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4550 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4550  porin  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  53.96 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  51.16 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  41.61 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  41.3 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  42.41 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  36.81 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  36.79 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  38.43 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  38.58 
 
 		 257 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  35.85 
 
 		 284 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  35.21 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  35.66 
 
 		 274 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  38.1 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  34.8 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  34.43 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  35.34 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  31.7 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  32.6 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  29.39 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  30.63 
 
 		 229 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  29.39 
 
 		 278 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  29.74 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  29.34 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  30.59 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  29.38 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  29.41 
 
 		 284 aa  85.9  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  29.39 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  27.19 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  27.72 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  27.11 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  27.4 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.38 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  24.6 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  23.83 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  23.05 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  26.44 
 
 		 222 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  25.46 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  25.64 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  25.64 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  24.62 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.42 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  25.36 
 
 		 236 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  27.85 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  26.47 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  26.85 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  25.17 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  27.27 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  21.55 
 
 		 213 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  28.28 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4363  hypothetical protein  26.71 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  28.19 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  35.48 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  30.26 
 
 		 230 aa  42.7  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  30.26 
 
 		 230 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>