54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3065 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  100 
 
 		 270 aa  540  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  76.21 
 
 		 279 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  55.07 
 
 		 285 aa  241  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  54.19 
 
 		 285 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  58.04 
 
 		 286 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  35.8 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  36.25 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  35.62 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  35.59 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  34.62 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  34.62 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  33.06 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  32.04 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  32.75 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  36.29 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  33.68 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  32.42 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  32.97 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  31.46 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  31.09 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  32.79 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  30.8 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  35.5 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  29.8 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  33.05 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  31.44 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  29.72 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  30.08 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  31.48 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  29.79 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  31.27 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  31.48 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  30.62 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  32.81 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  30.41 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.73 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.8 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  28.91 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  21.98 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  30 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  31.11 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  31.11 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  26.72 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  27.01 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  25.9 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  25.9 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  28.08 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  25.9 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  25.9 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2342  hypothetical protein  27.63 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.57 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  28.16 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.71 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  27.41 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>