61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3165 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  49.31 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  48.81 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  48.45 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  46.9 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  50 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  45.32 
 
 		 274 aa  205  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  44.91 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  43.04 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  37.76 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  37.07 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  38.28 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  36.5 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  36.16 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  32.03 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  30.71 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  31.67 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  35.54 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  35.54 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  36.5 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  35.12 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  30.98 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  30.28 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  30.07 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  35.32 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  35.32 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  30.3 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  31.08 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  33.89 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  28.32 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  33.48 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  34.5 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  26.98 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  27.59 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  30.51 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  28.11 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  30.45 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  31.22 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  29.45 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  33.61 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  33.08 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  29.86 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  29.86 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  29.86 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  29.86 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  28.28 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  25.31 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  30.65 
 
 		 209 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 		 373 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  24.59 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  30.97 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  31.25 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  32.52 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.16 
 
 		 196 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  28.24 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  26.8 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  26.8 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  23.84 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  25.7 
 
 		 232 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  31.36 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  23.56 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>