46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4339 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  100 
 
 		 330 aa  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  50.44 
 
 		 316 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  43.95 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  42.3 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  41.99 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  42.94 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  36.25 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  36.16 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  36.62 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  35.88 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  36.84 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  35.98 
 
 		 257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  34.68 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  33.45 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  32.97 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  31.8 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  31.45 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  32.39 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  27.27 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  32.69 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  28.86 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.48 
 
 		 227 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  27.78 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  27.22 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  27.89 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  26.9 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  26.15 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  27.7 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  28.32 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  27.3 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  29.43 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  29.43 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  27.21 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  26.62 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  25.55 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  24.42 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  27.23 
 
 		 401 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  22.01 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  25.42 
 
 		 409 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  23 
 
 		 213 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  22.15 
 
 		 222 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  33.33 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  32 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  32 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  22.31 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  21.56 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>