49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2971 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  76.37 
 
 		 290 aa  417  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  63.27 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  62.59 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  62.13 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  62.23 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  50.69 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  40.89 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  40.76 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  38.1 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  38.49 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  33.57 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  36.61 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  36 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  36.08 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  31.58 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  30.66 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  31.02 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  32.55 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  34.96 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  33.75 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  30.74 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  34.96 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  31.11 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  30.83 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  30.86 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  33.2 
 
 		 270 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  29.84 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  34.18 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  31.25 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  31.25 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  27.17 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  28.78 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  26.92 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  23.29 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.43 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.88 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.88 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.88 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  27.08 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  28.88 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.07 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2342  hypothetical protein  29.12 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  26.15 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  25.88 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  31.18 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  25 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  23.98 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  26.04 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>