42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2621 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  60.99 
 
 		 278 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  57.4 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  60.44 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  47.59 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  43.22 
 
 		 274 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  43.59 
 
 		 274 aa  205  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  47.08 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  40 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  36.11 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  35.76 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  35.36 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  37.16 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  33.06 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  35.24 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  32.86 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  32.23 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  30.53 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  31.58 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  31.6 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  34.1 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  33.2 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  33.2 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  28.68 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  32.34 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  32.81 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  32.81 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  32.81 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  33.33 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  32.62 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  25.99 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  24.36 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  26.16 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  23.28 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  30.09 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  30 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  26.24 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  25.73 
 
 		 401 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  27 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.77 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  27.32 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>