57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3066 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  56.71 
 
 		 287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  56.38 
 
 		 287 aa  305  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  56.86 
 
 		 288 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  53.96 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  44.74 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  39.69 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  40.69 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  39.6 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  39.08 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  36.53 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  37.9 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  37.75 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  38.91 
 
 		 284 aa  149  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  36.33 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  35.66 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  36.05 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  35.8 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  32.31 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  36.4 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  32.16 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  31.58 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  31.79 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  29.8 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  29.82 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  30 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  30.58 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  29.86 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  29.48 
 
 		 227 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  31.15 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  31.17 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  28.78 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  28.41 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  28.09 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  24.55 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  26.29 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.92 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  26.29 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  26.29 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  26.29 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  26.29 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  25.98 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  27.36 
 
 		 378 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  27.72 
 
 		 378 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  25.9 
 
 		 409 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  26.49 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  25 
 
 		 224 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30.46 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30.46 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  31.51 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.99 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  29.55 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  29.66 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  27.05 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  26 
 
 		 209 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  26.86 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  24.29 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>