99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4755 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  65.04 
 
 		 245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  37.5 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  37.5 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  38.18 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  35.27 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  31.1 
 
 		 223 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  34.85 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  31.47 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  33.33 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  26.09 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  31.09 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.55 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  30.18 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  26.86 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  34.15 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  34.15 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  26.89 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  27 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  27.05 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  32.33 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  29.2 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  33.08 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  33.08 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  27.92 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  27.92 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  28.81 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  31.06 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  32.35 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  30.07 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  29.23 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.85 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  27.49 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  26.16 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  30 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  28.8 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  22.22 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  25 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  30.28 
 
 		 409 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  29.87 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  33.08 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  26.21 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  31.13 
 
 		 183 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  31.75 
 
 		 186 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  29.85 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  33.33 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  29.55 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  26.62 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  32.58 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  29.55 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  29.01 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  28.26 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  27.78 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  25.15 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  28.75 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  32.09 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  30.77 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 		 373 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  28.75 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  32.03 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  29.25 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  30 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  30 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  27.92 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  23.83 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2040  hypothetical protein  24.9 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  30.06 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  26.29 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  23.05 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  26.14 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  31.43 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  29.92 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  28.35 
 
 		 201 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  27.35 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  26.12 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  29.13 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  28.26 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  29.25 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  29.25 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  28.97 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  33.7 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  25.6 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  25.76 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  29.91 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  27.73 
 
 		 227 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.67 
 
 		 997 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2233  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30 
 
 		 479 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788177  normal  0.216177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  28.72 
 
 		 401 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  28.3 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  30.65 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  32.97 
 
 		 238 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0583  hypothetical exported membrane spanning protein  26.26 
 
 		 259 aa  42  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0248013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>