54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5382 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  86.01 
 
 		 285 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  86.36 
 
 		 285 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  60.18 
 
 		 279 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  57.96 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  41.23 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  40.81 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  40.08 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  37.31 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  36.24 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  33.97 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  34.31 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  34.05 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  33.45 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  32.48 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  32.1 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  32.96 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  33.46 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  33.75 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  35.82 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  36.36 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  34.57 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  33.09 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  35.97 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  32.94 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  31.34 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  34.44 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  31.05 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  27.84 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  31.02 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  35.21 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  35.67 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  27.49 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  28.79 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  34.51 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.83 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  32.33 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.42 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  28.42 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.14 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.42 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.42 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  23.08 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  34.13 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  30.77 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  29.21 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30.77 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30.77 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  31.34 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  29.49 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  30.97 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  27.16 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  24.39 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>