37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0226 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  39.52 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  39.52 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  25.85 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  39.52 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  39.52 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  28.64 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  42.35 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  28.34 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  22.32 
 
 
285 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  25.89 
 
 
297 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  21.46 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  23.28 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  25.26 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  26.6 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  25 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  25.51 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  24.87 
 
 
316 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  28.48 
 
 
284 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  28.48 
 
 
284 aa  52  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  24.06 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  22.5 
 
 
288 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  26.18 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  22.7 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  24.59 
 
 
282 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.92 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  22.5 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  23.38 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  21.61 
 
 
278 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  25.95 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  24.74 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  29.89 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  25.66 
 
 
378 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  23.81 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  27.93 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  22.22 
 
 
286 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  32.97 
 
 
263 aa  42  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>