51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4836 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  98.95 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  89.36 
 
 		 286 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  59.06 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  54.87 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  41.85 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  41.61 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  41.24 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  36.55 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  34.5 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  33.46 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  31.2 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  33.07 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  34.6 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  33.83 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  33.33 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  36.05 
 
 		 284 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  32.59 
 
 		 291 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  35.32 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  34.33 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  31.12 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  31.28 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  31.87 
 
 		 229 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  32.82 
 
 		 290 aa  92  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  33.98 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  33.98 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  29.85 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  32.9 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  30.2 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  30.71 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  26.3 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  25.76 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  27.87 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  33.08 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  33.75 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  33.8 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  35.48 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  32.33 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  33.1 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  28.26 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  21.46 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  26.82 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  29.23 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  29.23 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  26.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  26.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  26.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  26.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  26.29 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  26.92 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  29.32 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>