54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1046 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  46.8 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  31.05 
 
 		 245 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  31.1 
 
 		 263 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  33.15 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  33.15 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  33.15 
 
 		 239 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  33.15 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  35.81 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.57 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.17 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  28.26 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  29.55 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  29.52 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  27.86 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  28.43 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  32.46 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  26.37 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  34 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  28.5 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  31.34 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13171  hypothetical protein  43.84 
 
 		 104 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.66 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  30.95 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  27.44 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  28.07 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  28.08 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  28.07 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  29.72 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  36.84 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  34.38 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  33.33 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  33.33 
 
 		 340 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  26.19 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  28.57 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  28.64 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  28.64 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1996  tia invasion determinant  23.74 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768055  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  29.32 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  26.29 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25.85 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2179  hypothetical protein  24.83 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  26.29 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  28.28 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  36.49 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  34.72 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  28.06 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  30.95 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  31.25 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  28.1 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  25.96 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  29.09 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  28.44 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>