23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1283 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  90.21 
 
 
378 aa  707    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  779    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  35.21 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  29.26 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  33.8 
 
 
285 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  33.8 
 
 
285 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  28.09 
 
 
257 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2340  hypothetical protein  32.54 
 
 
242 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  30.09 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  27.72 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  24.76 
 
 
266 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  26.17 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  29.23 
 
 
279 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  36.21 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0101  hypothetical protein  31.37 
 
 
260 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0115  hypothetical protein  31.37 
 
 
260 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  25.24 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  29.73 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  42.62 
 
 
273 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  42.22 
 
 
238 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  40.98 
 
 
273 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  40 
 
 
236 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  40 
 
 
236 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>