18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1284 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  776    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  90.21 
 
 
378 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  34.51 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  27.69 
 
 
274 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  33.1 
 
 
285 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  31.69 
 
 
285 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2340  hypothetical protein  32.54 
 
 
242 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  28.28 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  29.2 
 
 
316 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0101  hypothetical protein  31.37 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0115  hypothetical protein  31.37 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  36.21 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  28.46 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  25.66 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  25.25 
 
 
266 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  34.44 
 
 
219 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  40.98 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>