55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1818 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  74.49 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  72.02 
 
 		 266 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  67.45 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  63.05 
 
 		 290 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  61.57 
 
 		 284 aa  275  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  52.24 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  43.41 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  39.53 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  37.75 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  37.35 
 
 		 287 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  37.35 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  37.32 
 
 		 316 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  33.85 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  34.15 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  34.39 
 
 		 282 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  31.23 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  34.68 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  29.48 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  29.1 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  30.99 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  30.58 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  32.23 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  31.71 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  37.57 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  31.08 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  30.8 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  35.16 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  29.12 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  31.49 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  32.65 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  27.95 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.98 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  30.22 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  25.3 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  25.42 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  25.4 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  28.09 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  28.34 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.76 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  26.53 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  27.04 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  27.04 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  26.53 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  25.87 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  26.97 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  28.75 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  28.63 
 
 		 380 aa  45.8  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  26.26 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  26.26 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  29.1 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  29.6 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  25.93 
 
 		 195 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  28.24 
 
 		 202 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>