61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2558 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  47.93 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  45.68 
 
 
266 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  46.43 
 
 
257 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  39.59 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  41.67 
 
 
291 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  39.72 
 
 
284 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  40.74 
 
 
274 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  37.5 
 
 
297 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  38.46 
 
 
316 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  38.06 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  36.9 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  37.65 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  33.33 
 
 
330 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  32.71 
 
 
274 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  31.58 
 
 
274 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  30.38 
 
 
229 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  31.2 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  30.77 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  31.22 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  30.51 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  28.77 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  31.78 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  31.36 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  30.39 
 
 
284 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  30.04 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  28.81 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  31.73 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  28.52 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  32.17 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  31.22 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  28.26 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  24.91 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  30.04 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  32.02 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  28.4 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  27.54 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  27.54 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  27.27 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  28.12 
 
 
195 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  26.34 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  26.34 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  26.34 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  26.34 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  35.48 
 
 
225 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.32 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 
373 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  26.09 
 
 
224 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  31.07 
 
 
186 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  24.89 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  32.97 
 
 
212 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  25.28 
 
 
238 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  31.2 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  31.25 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  30.28 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  30.28 
 
 
181 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  25.57 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  28.47 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  30.95 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  24.73 
 
 
378 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>