42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3966 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  100 
 
 
268 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  43.52 
 
 
238 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  43 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  43 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  28.88 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.88 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.88 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.88 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  27.55 
 
 
219 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  26.37 
 
 
223 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  28.8 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  31.68 
 
 
245 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  28.26 
 
 
285 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  28.81 
 
 
359 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  28.5 
 
 
401 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  29.01 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  28.99 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  28.9 
 
 
225 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  26.28 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  30.87 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  25.78 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  26.92 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  30.53 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  29.31 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  27.56 
 
 
196 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3201  outer membrane protein  23.58 
 
 
178 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  32.76 
 
 
202 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3265  outer membrane protein  23.77 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.45758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3250  outer membrane protein  23.58 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0628701  normal  0.157037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3187  outer membrane protein  23.58 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3366  outer membrane protein  23.77 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  25.84 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  23.08 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  25.47 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  24.12 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 
376 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.13 
 
 
222 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  29.08 
 
 
195 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  35 
 
 
284 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  25.73 
 
 
287 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  35 
 
 
284 aa  42  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  25.73 
 
 
287 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>