74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2694 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  65.9 
 
 		 213 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  50.67 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  50 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  49.32 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  46.49 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  31.6 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.84 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  29.23 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  33.7 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  30.8 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  31.31 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.73 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  32.84 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  32.24 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  29.72 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  31.1 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  30.22 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  27.54 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  25.96 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  32.23 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  30.43 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.29 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  31.75 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  29.67 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  29.38 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  27.01 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  27.6 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  26.59 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  28.5 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  28.26 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  27.55 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  29.95 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.36 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  24.87 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  25.91 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  28.37 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  27.85 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  28.03 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  29.19 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  35.23 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  37.18 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  29.65 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  24.44 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  24.69 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  24.9 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  31.5 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  23.83 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  31.25 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  24.43 
 
 		 401 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  28.04 
 
 		 373 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  26.85 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  30.17 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  30.17 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  25 
 
 		 357 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  27.14 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  27.14 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  27.56 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  27.14 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  27.14 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  27.78 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  26.09 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  27.56 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1137  major outer membrane protein OMP-1C  22.73 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.135589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.93 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  24.48 
 
 		 409 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  27.83 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2861  hypothetical protein  31.36 
 
 		 184 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  30 
 
 		 268 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13171  hypothetical protein  32.47 
 
 		 104 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  23.5 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0916  surface antigen msp4  23.49 
 
 		 278 aa  41.6  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0295969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>