67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0394 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  100 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  52.66 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  49.03 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  48.66 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  43 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  41.84 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  39.67 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  40.57 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  38.8 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  36.7 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  34.78 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  36.22 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  36.12 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  34.48 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  33.48 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  33.47 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  30.05 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  30.2 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  30.05 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  32.34 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  33.5 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  29.33 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  31.86 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  30.86 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  27.73 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  31.6 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  31.94 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  25.58 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  30.57 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  30.14 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  28.87 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  37.17 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  28.17 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  27.13 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  27.59 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  36 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  36 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  36 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  36 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  25.97 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  33.1 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  25.97 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  29.61 
 
 		 373 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  38.82 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  30.59 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  30.59 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  31.53 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 		 401 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  28.35 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  27.22 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  28.02 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  36.84 
 
 		 284 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  36.84 
 
 		 284 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  29.46 
 
 		 373 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  31.65 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  28.14 
 
 		 284 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  26.24 
 
 		 361 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  24.88 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  33.68 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  27.48 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  29.49 
 
 		 266 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2179  hypothetical protein  31.82 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  28.21 
 
 		 373 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2812  hypothetical protein  25.42 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.14111  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  28.57 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>