65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0302 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  46.32 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  43.92 
 
 
186 aa  147  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  45.41 
 
 
190 aa  147  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  47.09 
 
 
203 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  42.47 
 
 
183 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  41.26 
 
 
206 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  44.5 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  40.23 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  45.21 
 
 
202 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  44.19 
 
 
196 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  39.71 
 
 
202 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  38.25 
 
 
201 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  38.81 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  28.99 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  32.2 
 
 
227 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  29.36 
 
 
237 aa  90.5  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  32 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  29.96 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  28.21 
 
 
222 aa  88.6  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  30.26 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  29.91 
 
 
234 aa  77.8  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  31.48 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  30.6 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  29.72 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  30.85 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  30.21 
 
 
212 aa  74.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.58 
 
 
222 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  28.11 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  26.2 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  29.75 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  31.06 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  31.45 
 
 
239 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  31.45 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  31.45 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  31.45 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  32.69 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  39.22 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  29.23 
 
 
263 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  30.11 
 
 
229 aa  54.7  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  32.58 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  29.73 
 
 
357 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  34.48 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  36.84 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  27.75 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  27.75 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1426  hypothetical protein  35.06 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  31.2 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 
373 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  26.81 
 
 
373 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  29.89 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  26.7 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  28.47 
 
 
283 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  30.15 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  32.82 
 
 
287 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  33.33 
 
 
340 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  29.3 
 
 
288 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  32.29 
 
 
229 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  29.59 
 
 
228 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  29.08 
 
 
268 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
401 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  25.7 
 
 
213 aa  41.6  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  32.06 
 
 
287 aa  41.2  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>