55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2205 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  35.19 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  33.76 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  33.05 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  35.55 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  36.09 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  32.39 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  34.43 
 
 		 194 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  32.82 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  32.7 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  36.32 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  31.7 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  30.89 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  31.75 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  34.18 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  31.16 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  30.41 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.25 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  32.49 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  33.51 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  33.16 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  31.48 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  31.65 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  27.7 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  31.31 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  32.12 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  30.11 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  27.31 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.78 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  27.67 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  29.69 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  29.57 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  28.04 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.19 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  26.42 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  26.42 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  26.42 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  26.42 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  27.75 
 
 		 263 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  27.16 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  30.92 
 
 		 373 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  27.69 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  26.36 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  27.88 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  26.06 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  27.31 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  26.72 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  27.52 
 
 		 274 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  27.52 
 
 		 274 aa  45.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  34.09 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  27.98 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  26.95 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  29.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  29.57 
 
 		 287 aa  42  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>