30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0583 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0583  hypothetical exported membrane spanning protein  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0248013  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1574  hypothetical protein  98.84 
 
 
259 aa  521  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0584  hypothetical protein  37.45 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0229042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1573  hypothetical protein  36.7 
 
 
273 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000986771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1575  hypothetical protein  37.59 
 
 
263 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0582  hypothetical protein  37.59 
 
 
263 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0138735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  24.7 
 
 
559 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  26.48 
 
 
562 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  26.15 
 
 
561 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  28.12 
 
 
997 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  23.38 
 
 
652 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  27.07 
 
 
255 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  28.8 
 
 
258 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  28.02 
 
 
242 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  26.86 
 
 
570 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  29.35 
 
 
570 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  27.06 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  27.07 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  28 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  25.45 
 
 
566 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  23.91 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  22.74 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  28.25 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.19 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  28.02 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  28.33 
 
 
550 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.78 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  26.09 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  27.56 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  26.26 
 
 
263 aa  42  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>